衛生快速檢測系統也叫做細菌微生物檢測儀，其中主要用到的是ATP拭子，ATP拭子含有可以裂解細胞膜的試劑，能將細胞內ATP釋放出來，與試劑中含有的特異性酶發生反應，產生光，再用熒光照度計檢測發光值，微生物的數量與發光值成正比，由于所有生物活細胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明樣品中微生物與其他生物殘余的多少，用于判斷衛生狀況。

食品的微生物狀態是食品整個生產過程的一系列環節中（包括從原材料的生產、加工到成品的經營、銷售以及售后使用等）因素的綜合結果，食品微生物檢測的過程中的質量控制直接對于檢測結果的準確性、科學性造成了影響。提升檢測質量的方式包括工作人員專業技術水平、實驗室環境、儀器設備、以及管理等各個方面，想要提高檢測的質量和效率，就要對微生物檢測的過程和背景上進行分析，從而得出相應的解決措施。